Zant, o shadow king, atacou a Princesa Zelda numa tentativa de dominar Hyrule. Desde então, o reino imergiu na escuridão crepuscular, e seus habitantes tiveram as almas roubadas, condenados a vagar sem destino. Nesta dimensão, onde Link se vê transformado em lobo, ele embarca em uma jornada para restaurar o mundo da luz junto de Midna.