Seus manuscritos compreendem anotações sobre a flora, a fauna, as populações nativas, a geografia, a etnografia, a medicina e assuntos gerais, apresentando um amplo painel sobre o que era a região no século XVIII. Pelo significado e riqueza do farto material coletado, bem como seus manuscritos, é considerado um dos grandes naturalistas-viajantes do seu tempo, sendo apelidado de Humboldt brasileiro.